目前有两种HPV疫苗： Gardasil® 和 Cervarix®, 都是预防性疫苗，而非治疗性疫苗，预防由高危型16和18型HPV引起的宫颈癌，主要用于9－26岁年轻女性。
疫苗和筛查 －联合细胞学与HPV检测 －在宫颈癌预防中的重要作用。
对于年轻女性，接种疫苗虽然能够预防大部分HPV感染，但是在未来的几十年，疫苗的使用不能完全取代筛查。原因之一就是，疫苗虽然能预防在接种后一段时间内不感染高危型HPV，但是对于已经存在的HPV感染，疫苗并没有治疗作用。而通过现有的HPV检测技术进行宫颈癌筛查，临床医生可以更好地发现高危人群并采取适当的追踪管理。
不论现在，还是将来，最有效的宫颈癌防治手段都必须包括一级预防和二级预防。即便疫苗已经开始使用，专家仍建议女性根据年龄，定期进行细胞学和HPV的筛查。这是因为：
疫苗所能提供的保护作用是有限的。已经证实，与宫颈癌相关的高危型HPV超过13种，现在使用的疫苗只是对其中两种和70％宫颈癌相关的HPV病毒具有预防作用。如果女性感染了和另外30％宫颈癌相关的其它高危型HPV，则疫苗就不具有保护作用。
女性如果在接种疫苗前已经有过高危型HPV感染，那么疫苗的保护作用就会降低。
疫苗保护作用所持续的时间还不完全确定。是否需要通过二次注射以确保其作用的持续性，是尚待解决的问题之一
专家认为，在未来几年内，对年轻女性注射HPV疫苗，并不能显著降低宫颈癌的发病率。是否能有效地减少宫颈癌，取决于以下多方面因素：
因此，疫苗和筛查在宫颈癌预防中都具有重要意义。HPV疫苗未被批准用于26岁以上的女性，但是，医生可以对30岁及以上女性进行HPV检测，了解其是否感染HPV。
